La Société historique de Saint-Boniface est dirigée par un conseil d’administration qui doit se composer d'un maximum de 13 personnes et d'un minimum de 7 personnes. Ces personnes sont élues lors de l’assemblée générale annuelle de l’organisme qui a lieu en mai ou juin de chaque année. Suite aux élections, les membres du conseil d’administration élisent entre eux les membres du bureau de direction composé du président, du vice-président, du trésorier et du secrétaire.

Le conseil d’administration de 2019-2020 est composé des membres suivants :
Président : Michel Lagacé
Vice-présidente : Michelle Keller
Trésorière : Lianne Desrochers
Secrétaire : 
Conseillers/conseillères: Louis Paquin, Joël Ruest, Lucille Bazin, Philippe Mailhot, Henri Bouvier, Camille Fisette-Mulaire et Me Guy Jourdain.